下記の手順で個別に着信履歴を削除することができます。

ホーム画面で［電話/電話帳］→「通話履歴」タブに表示された削除したい番号を選択→［メニュー］→［通話履歴から削除する］→［削除する］

また、シンプルホームをご利用の場合は、ホーム画面の［電話］を選択し、上記同じ手順で着信履歴を削除してください。