アプリ一覧に表示されるアプリについては、並び順は変更できませんが任意のアプリを非表示にすることができます。
【アプリを非表示にする方法】
1.アプリケーション一覧画面で［メニュー］→「アイコン非表示」を選択する
2.非表示にしたいアイコンにチェックを付け、「保存」を押す。

ホームに表示されるアプリについては、任意のアプリアイコンを長押しし、そのまま移動したい場所へドラッグすることで移動させることができます。